Für viele Unternehmen hat das Einhalten von Spezifikationen zu geringen Kosten und eine hohe Produktqualität einen hohen Stellenwert. Dabei sind gerade im Bereich Qualität viele Aspekte mit einzubeziehen. Wonderware Applikationen sind daher bereits vielfach zu diesem Zweck im Einsatz.
Zu den Anwendungen, die Wonderware in diesem Bereich anbieter gehören z.B. InTouch HMI mit seiner Datenüberwachung in Echtzeit sowie Alarming; der Wonderware Historian zur Speicherung großer Datenmengen zur späteren Qualitätsanalyse; QI Analyst mit unternehmensweiter Qualitätskontrolle; ActiveFactory mit seinen Datentrends; Operations und Performance Software inkl. Verwaltung von Spezifikationen, Genealogy, BOM Bearbeitung, OEE und Stillstandszeitüberwachung; System Platform und InBatch und viele mehr.